更名对于中央人民政府在港澳的机构设置可能带来多方面的调整。一方面，在职能上可能重新界定。以原中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室更名为中央人民政府驻香港特别行政区维护国家安全公署为例，更名后该机构的核心职能聚焦于维护国家安全，从更宽泛的联络协调等职能转变为特定且关键的安全维护职责，使得机构在港澳地区的工作方向更加精准。

另一方面，组织架构也可能因更名而调整。更名往往伴随着工作重点的转移，这就需要对内部的部门设置、人员配置等进行优化。比如可能增设与新职能相关的部门，或者对原有的一些部门进行合并或撤销，以提高工作效率和适应新的工作要求。

再者，在管理模式上也会有改变。更名后的机构可能会与港澳本地的相关部门建立新的协作机制。以前的联络办公室更多是进行沟通协调工作，而维护国家安全公署则需要与港澳警方、司法等部门建立更紧密的联合执法、信息共享等合作模式，以更好地履行维护国家安全的使命。