要确定南通市地图的最新版本是否标注了2025年行政区划调整后的崇川区、通州区和海门区边界，需要考虑多方面因素。

首先，行政区划调整通常有一系列的流程和时间安排。截至目前，2025年的行政区划调整尚未实际发生，也就无法确定调整后的具体边界情况。在行政区划调整方案正式确定并公布实施前，地图制作方不会随意标注未确定的边界信息。

其次，地图的更新是有一定周期和依据的。地图制作需要依据权威的行政区划文件和数据。即使2025年发生了行政区划调整，地图更新也不会立刻完成，要经过数据收集、审核、制图等一系列过程。

所以，在2025年行政区划调整未明确且实施，以及地图未根据最新调整更新的情况下，南通市地图的最新版本大概率不会标注调整后的这三区边界。但如果调整完成且地图及时更新，就有可能标注。那么，南通市地图到底能不能在最新版本标注2025年行政区划调整后的这三区边界呢？