赵尔丰在川滇边推行“改土归流”政策，旨在加强中央集权、促进当地发展，但这一过程面临诸多阻力。

土司势力的抵制

土司在当地长期拥有高度自治权，掌控着土地、人口和经济资源。“改土归流”剥夺了他们的权力，使其失去既得利益。例如，一些大土司拥有自己的武装力量，他们会凭借武力对抗改流措施，发动叛乱以维护自身统治。像德格土司，曾试图联合周边土司共同抵制改流，给政策推行带来极大阻碍。

宗教因素的干扰

川滇边地区宗教氛围浓厚，寺庙在当地社会有巨大影响力。一些宗教上层人士担心“改土归流”会影响他们的宗教特权和经济利益。例如，寺庙拥有大量土地和佃户，改流后土地可能被重新分配，宗教收入会减少。他们利用宗教影响力煽动信众抵制改流，增加了政策推行的难度。

民众传统观念的束缚

当地民众长期受土司统治和传统习俗影响，对“改土归流”政策缺乏了解和认同。他们习惯了旧有的社会秩序和生活方式，对新的制度和管理方式存在疑虑和恐惧。同时，一些谣言在民间传播，使民众对改流产生抵触情绪，不愿意配合政策实施。

地理环境与交通的限制

川滇边地区地形复杂，高山峡谷众多，交通极为不便。这使得政府在推行政策时面临物资运输困难、信息传递不畅等问题。官员难以深入偏远地区宣传和执行政策，军队在平叛和维持秩序时也面临后勤保障难题，大大延缓了“改土归流”的进程。