贺衷寒在西安谈判中提出的“红军改编方案”遭到周恩来拒绝，这背后有着多方面的深层次原因。该方案严重损害红军利益与独立自主地位，与国共合作的初衷相背离。

方案违背已达成的共识

此前国共双方已进行了多轮接触和初步谈判，在一些关键问题上达成了基本共识。而贺衷寒提出的方案对之前商定的内容进行了大幅度修改。比如，原已认可红军改编后保持相对独立性，可该方案却试图大幅压缩红军编制，减少人数，限制红军的指挥权和自主性，这无疑是对前期谈判成果的公然否定，周恩来代表中共坚决维护已有的谈判基础，自然不能接受这种出尔反尔的方案。

损害红军实质利益

方案在军队改编的具体条款上对红军极为不利。在人员安排方面，企图安插国民党人员进入红军内部，干涉红军的领导和指挥体系，这会使红军面临被分化和控制的风险。在经费和装备等资源分配上，给予红军的支持远远低于合理水平，难以保障红军的正常发展和作战需求。这显然是国民党想通过此方案削弱红军力量，周恩来为了保障红军的生存和发展，必然会拒绝这一损害红军实质利益的方案。

危及中共政治地位

从政治层面看，该方案如果实施，会使中共在国共合作中的地位大幅下降。红军是中共领导的重要武装力量，若其被不合理改编和限制，中共在抗日民族统一战线中的话语权和影响力将被严重削弱，无法有效地领导和组织广大人民群众进行抗日斗争。周恩来深知保持中共政治地位和领导权的重要性，为了确保中共能够在抗日大局中发挥积极且独立的作用，果断拒绝了这一可能危及中共政治地位的方案。

综上所述，贺衷寒提出的“红军改编方案”无论是从违背共识、损害红军利益还是危及中共政治地位等方面，都与中共的原则和立场严重冲突，因此遭到周恩来的拒绝是必然的。