在司法大楼收复事件中，哥伦比亚政府对于被捕游击队员的处置措施是复杂且多维度的。通常而言，政府会依据国内法律来进行审判。在法律框架下，被捕游击队员会被指控相应罪行，如袭击政府机构、危害公共安全等，根据犯罪情节的轻重来量刑。

部分游击队员可能会面临长期监禁的刑罚，以起到惩戒和威慑作用，防止类似暴力活动再次发生。对于一些罪行相对较轻或者能够积极配合调查、交代相关信息的游击队员，政府可能会采取相对从轻的处罚，如通过减刑、假释等方式。

此外，为了促进国内和平与和解，哥伦比亚政府有时也会与游击组织进行谈判，将部分被捕游击队员作为谈判筹码，推动双方达成和平协议。在这种情况下，一些游击队员可能会获得特赦或者被释放，条件是他们承诺放弃武装斗争，重新回归正常社会生活。