五大连池保护区依据《自然保护区管理条例》划分，核心区严格保护，缓冲区限制人类活动，具体范围如下：

核心区涵盖14座火山锥体、5个熔岩堰塞湖及原始森林，禁止任何开发性活动。缓冲区位于核心区外围，包含部分农田和居民点，允许有限度的科研监测及生态修复。两区边界以物理界桩、电子围栏及地形标志物三重标识，坐标数据纳入省级自然资源监测平台实时管理。