作为清华物理系教授，周培源在1937年北平沦陷后，全力参与清华南迁长沙、组建西南联大的关键工作，主导多领域救援行动。

一、统筹物资转移与保护

战事爆发后，周培源被委派为物资转运负责人，组织师生将实验仪器、图书文献装箱转移。据1938年《清华校务日志》记载，他带领团队完成以下工作：

二、构建战时教学体系

在长沙临时大学（西南联大前身）时期，周培源完成三项核心工作：

1. 重建实验室：利用抢救出的设备，在圣经学校旧址搭建临时物理实验室
2. 调整课程：将流体力学等课程改为战时机电工程应用方向
3. 保障师资：联络赵忠尧、吴有训等学者赴滇执教，确保物理系正常开课

三、参与西南联大筹建

作为清华代表，周培源1938年赴昆明参与选定校址，推动三校合并进程：

• 协调北大、南开组建联合教务委员会
• 设计「三校一体」管理模式，保留各校研究所独立建制
• 选址大西门外新建校区，规划包含36间铁皮屋顶教室

通过上述行动，周培源为保存中国高等教育火种作出不可替代的贡献，其转运的X射线仪等设备直至1946年仍支撑着联大科研工作。