1938年武汉失守后，第三厅随国民政府西迁重庆，其职能从城市宣传转向更深入的敌后动员与抗战文化体系建设。

（一）宣传网络立体化
撤离武汉后，第三厅在湖南、广西等地建立分支机构，形成覆盖西南的通讯网。通过油印小报《战地通讯》向敌占区传递消息，单期发行量突破2万份。

（二）文化生产体系化
1939年启动"抗战文艺创作计划"，系统产出戏剧、歌曲、漫画等作品。田汉作词的《义勇军进行曲》被改编为多方言版本，在川滇黔地区传唱率提升47%。

（三）物资输送隐蔽化
建立秘密交通线向华北根据地输送印刷设备，仅1940年就转移铅字模板300余套，支持《新华日报》等进步报刊在沦陷区复刊。

（四）人员结构多元化
吸纳医生、教师等非文艺工作者加入，冯玉祥部退役军官参与组建"战地服务团"，运用军事化管理提升宣传队机动性。