孙中山在1921年就任非常大总统期间，面临多重内部分裂挑战，包括军事派系冲突、党内意见分歧及地方势力割据等问题。

一、军事派系矛盾

代表事件

陈炯明作为粤军首领，主张“联省自治”，与孙中山的北伐计划直接冲突，最终引发1922年“六一六兵变”。

二、党内政治分歧

1. 派系对立
   • 胡汉民、汪精卫等元老派与廖仲恺等激进派在“联俄联共”政策上立场不一。
   • 部分国民党成员对孙中山改组党务、引入新策略持保留态度。
2. 决策权争夺
   党内高层对财政分配、人事任免存在利益纠葛，削弱了统一行动能力。

三、地方势力割据

• 西南军阀：滇系、桂系名义支持护法，实际控制云南、广西税收与军队，拒绝接受调遣。
• 广东本土势力：商团、乡绅对孙中山的税收改革不满，多次引发地方冲突。

四、财政与资源困境

广州政府实际控制区域有限，主要依赖海外华侨捐款及广东一省税收，导致军费短缺，加剧内部权力倾轧。例如陈炯明因军费分配问题公开质疑孙中山的决策权威。

五、外部势力干预

列强通过扶持不同派系（如英国支持桂系）分化革命阵营，进一步激化内部矛盾。