集权派与联邦派的核心矛盾集中在权力分配、治理模式及国家结构设计上，具体差异可归纳为以下层面：

权力分配的逻辑差异
集权派强调国家整体利益优先，认为分散权力可能导致治理效率低下与政策执行偏差；联邦派则主张通过分权激发地方活力，避免权力过度集中引发腐败或决策脱离实际需求。

治理目标的冲突
集权派注重社会稳定与长期战略的一致性，例如通过统一的教育、税收制度减少内部矛盾；联邦派倾向于多元包容，认为差异化政策能更好适应人口、文化、资源分布不均的现实条件。

对国家结构的设想
集权派支持单一制国家框架，中央通过立法、人事任免等手段直接管控地方；联邦派则主张以契约形式明确中央与地方权责，例如通过宪法划分各自管辖范围，建立双向监督机制。