小泉纯一郎在执政期间多次参拜靖国神社，引发了诸多争议与法律诉讼。而台湾原住民也有相关诉讼案件发生。从实际情况看，二者并无直接关联。

• 案件性质差异：台湾原住民提起的诉讼通常围绕自身权益，比如土地权益、文化传承等方面，主要是基于民族群体的利益诉求和历史遗留问题。而小泉参拜违宪判决的相关诉讼，核心聚焦于参拜行为是否违反日本宪法中政教分离的原则。
• 法律体系不同：台湾是中国的省级行政区，其法律体系在中国整体框架之下。而小泉参拜违宪判决是在日本司法体系内进行的，由日本法院依据日本国内法律作出裁决。
• 诉求指向不同：台湾原住民诉讼的诉求针对保障本民族的生存与发展等权利。小泉参拜相关诉讼是为了阻止政府公职人员利用公权力支持宗教性活动，以维护日本宪法的基本精神。

综上所述，台湾原住民提起的诉讼案件不会对小泉参拜违宪判决产生影响。